百鬼夜行連合学院にて、新たなるエンシェント・ツキジ・ブケハウスが発見された。武家屋敷型のマグロ鉱山であるエンシェント・ツキジ・ブケハウスは、ツキジ・ダンジョンの中でも最上級とされており、その秘密地下空間に埋蔵されるコーベインマグロ貯蔵量は軽く見積もっても300tは絶対にあると専門家は口々に語っている。
しかしながらニンジャ真実の一端としてモータル生徒／大人には隠蔽されているツキジ・ダンジョンを大々的にその利権を獲得するべく学園側が動けば、そのニンジャ真実を知らない連邦生徒会に捕捉され厄介な事になる。そのベールを維持しながらも利権を獲得すべく、裏の世界の住民たる君達ニンジャが暗躍の片鱗に用いられるのであった…。
