ここはとある地方の高校「私立八馬高校」。
この学校は表向きでは普通の高校ですが、裏では御斎とつながり将来有望な忍者の卵たちを育てることを任務としています。
ですが、あくまで御斎の下位組織であるこの高校は、御斎学園とは違い上位教師たちの推薦がなければ、私立御斎学園の忍者となれません。
というわけで教員たちは、地方の名家から預かった忍者の卵たちを死ぬ気で鍛えあげ、私立御斎学園に所属できる忍者に育て上げようとするのですが……最近この学校で問題が起こりました。
3年C組が突如として担当教師を追い出し、授業をボイコット――学級崩壊を起こしたのです!
不良生徒の吹き溜まりとなった3-Cの扱いに、学園上層部は困り果てます。
その時、一人の教師が八馬高校へと赴任しました。
巻き起こる学級崩壊。それに巻き込まれた、PC3。
主犯であるPC2の目的は?
学級崩壊を受け学校に来なくなった、冴島透はきちんと登校できるようになるのか?
すべてはPC1──新任教師にゆだねられた!